Описание
ИНФОРМАЦИЯ О ВОЗБУДИТЕЛЕ БОЛЕЗНИ
Erwinia amylovora — возбудитель бактериального ожога – опаснейшего некротического заболевания растений семейства Rosaceae. Быстрое распространение бактерий через ткани хозяина может привести к гибели целых деревьев за один вегетационный период. Заражение цветков E. amylovora может значительно снизить урожайность и товарность. Фитопатоген является карантинным объектом для Республики Беларусь, стран Евразийского экономического союза и стран, входящих в Европейскую и Средиземноморскую организацию по карантину и защите растений (EPPO A2 list). Экономически наиболее значимыми хозяевами для E. amylovora являются Pyrus spp., Malus spp., Cydonia spp., Eriobotrya japonica, Cotoneaster spp., Crataegus spp., Pyracantha, spp. и Sorbus spp.
ПРИНЦИП МЕТОДА
«ALSENSE Erwinia amylovora» разработан на основе рекомендаций Европейской и Средиземноморской организации по карантину и защите растений (EPPO) и позволяет детектировать ДНК патогена методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Мишенью для амплификации является участок ams-оперона Erwinia amylovora. Внутренний контроль (ВКО) разработан на основе последовательностей генов 18S рибосомной РНК яблони и груши. Зонд TaqMan® к участку генома Erwinia amylovora несет на 5’-конце метку-краситель FAM. ВКО-специфичный зонд мечен флуорофором HEX, что позволяет пользователю валидировать этап экстракции ДНК из растений.
РЕКОМЕНДАЦИИ К ОТБОРУ ОБРАЗЦОВ
«ALSENSE Erwinia amylovora» валидирован для одновременного обнаружения Erwinia amylovora и растительной ДНК с помощью ПЦР в режиме реального времени. Для предварительной экстракции ДНК рекомендуется использовать образцы цветков, не одревесневших побегов, листьев и плодов (желательно с симптомами некроза и/или экссудатом). Оптимально использование свежих образцов растительной ткани, однако допустимо их хранение при температуре от +4 до +8 °C не более 1 недели.
