Описание
ИНФОРМАЦИЯ О ВОЗБУДИТЕЛЕ БОЛЕЗНИ
Pantoea stewartii subsp. stewartii — неподвижная, не образующая спор грамотрицательная бактерия, вызывающая бактериальное увядание кукурузы. В основном поражает Zea mays, особенно Zea mays subsp. saccharata, рис посевной, некоторые злаки. Фитопатоген является карантинным объектом для Республики Беларусь, стран Евразийского экономического союза и стран, входящих в Европейскую и Средиземноморскую организацию по карантину и защите растений (EPPO A2 list).
ПРИНЦИП МЕТОДА
«ALSENSE Pantoea stewartii subsp. stewartii» разработан на основе рекомендаций Европейской и Средиземноморской организации по карантину и защите растений (EPPO) и позволяет детектировать ДНК патогена методом полимеразной цепной реакции в режиме реального времени. Мишенью для амплификации является участок гена cpsD Pantoea stewartii subsp. stewartii. Внутренний контроль (ВКО) разработан на основе последовательности генов 18S рибосомной РНК растений-хозяинов. Зонд TaqMan® к участку генома Pantoea stewartii subsp. stewartii несет на 5’-конце метку-краситель FAM. ВКО-специфичный зонд мечен флуорофором HEX, что позволяет пользователю валидировать этап экстракции ДНК из растений.
РЕКОМЕНДАЦИИ К ОТБОРУ ОБРАЗЦОВ
«ALSENSE Pantoea stewartii subsp. stewartii» валидирован для одновременного обнаружения Pantoea stewartii subsp. stewartii и растительной ДНК с помощью ПЦР в режиме реального времени. В качестве исследуемого материала предпочтительно использовать листья, цветы и семена с типичными симптомами заболевания.